Programmbereich Infektionen
Molekulare und Experimentelle Mykobakteriologie
Mission 
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Mission
Die Bekämpfung der Tuberkulose und anderer Lungenerkrankungen durch ein besseres Verständnis der Erreger aus dem M. tuberculosis Komplex (Mtbk) und weiterer bakterieller Lungenpathogene ist das zentrale Ziel der Forschungsgruppe. Die translationale Forschungsagenda umfasst folgende Schwerpunkte: lokale und globale Transmissionsdynamik, Aufklärung von Resistenz- und kompensatorischen Mechanismen, Populationsstruktur und Evolution der Mtbk‑Stämme bzw. anderer Mykobakterien, Virulenz, Physiologie und Pathobiologie von Mykobakterien, Anwendung von Hochdurchsatz‑Technologien in Forschung und Diagnostik sowie individualisierte Therapie und Evolutionäre Medizin (Fig. 1).
Die Arbeiten der FG basieren auf einer exzellenten methodischen Expertise. "Next Generation Sequencing" (NGS) Verfahren werden für die hochauflösende Charakterisierung von Erregergenomen und Transkriptomen eingesetzt. Derzeit werden im Pathogenomik-Labor ca. 300 Stämme pro Woche sequenziert. Insgesamt sind NGS-Daten von mehr als 15.000 Mtbk‑Stämmen für weiterführende Analysen verfügbar. Eine entsprechende IT‑Infrastruktur wurde ausgebaut (Server, Speicher) und bioinformatische Analyseverfahren werden kontinuierlich weiterentwickelt. Im Pathobiologie-Labor stehen in vitro und in vivo Modelle zur Analyse klinischer Mtbk-Stämme in pathobiologisch relevanten Stresssituationen (Sauerstoffdefizit/Dormanz, Antibiotika, Infektion) mit angeschlossen Verfahren zur DNA-, RNA- und Proteinanalyse zur Verfügung. Die Validierung relevanter Target-Gene ist direkt durch etablierte "Gen-KnockOut" Verfahren in Mtbk-Stämmen möglich.
Fig. 1. Main research topics of the FG Molecular and Experimental Mycobacteriology in relation to the FZB focus areas TBcontrol and TBcare.